冷冻保存可能存在对燕窝的质地和口感产生一定影响，因而建议仅在必要时采用此方法。冷冻保存的燕窝在解冻后应尽快食用，以保障其更佳品质。污染是引起燕窝变质的主要起因之一。在储藏燕窝时，应保障环境清洁，避免与有害物质接触。同时在食用燕窝前要检查包装是不是完好，防止细菌侵入。